Tudo começa quando o avô de Marie Pérola falece. Após sua morte, Marie descobre que o avô havia deixado para ela uma garrafa, que continha um barco dentro, mas o que ela não sabia era que dentro daquela garrafa continha um imenso poder, porém, junto ao poder havia uma maldição de 200 anos, capaz de acabar com a vida de Marie e de sua família.
Marie acaba sendo sequestrada pelo maléfico Capitão Diabolik e sua leal Feiticeira Quimera. O pai de Marie e sua melhor amiga, Artêmis, seguem juntos atrás da Feiticeira e do Capitão Diabolik para resgatá-la.
Nesse meio tempo, surgem os marujos Dante, Hidra e Matoso que estão em busca de seu capitão, o maldoso Capitão Diabolik, mas para que possam encontrá-lo, terão que passar por histórias inusitadas.
Marie e Capitão Diabolik ficarão frente a frente e realizarão uma grande batalha entre o bem e o mal.
